Taman Nasional Taka Bonerate merupakan taman laut dengan kawasan atol terbesar ketiga di dunia, setelah Kepulauan Marshall dan Suvadiva di Kepulauan Maladewa . Hamparan atol ini terbentang sekitar 220 ribu hektare, dengan sebaran terumbu karang hingga 500 kilometer persegi.
Ada 15 pulau di wilayah TN Taka Bonerati, yang jadi tujuan favorit untuk menyelam, snorkeling, dan wisata bahari lainnya. Topografi kawasan sangat unik dan menarik, di mana atol yang terdiri dari kelompok pulau-pulau karang dan rataan terumbu yang luas dan tenggelam, membentuk pulau-pulau dengan banyak yang cukup banyak.
Di sela pulau-pulau gosong karang, terdapat selat-selat sempit yang dalam dan terjal. Sedangkan pada proses permukaan rataan terumbu, banyak terdapat kolam kecil yang dalam dan dikelilingi oleh terumbu karang. Pada masa air surut terendah, terlihat dengan jelas daratan kering dan diselingi genangan air yang membentuk kolam-kolam kecil.
Di kawasan Taka Bonerate terdapat setidaknya 244 jenis moluska dan banyak nudibranch atau yang sering disebut dengan siput telanjang. Kawasan itu juga merupakan rumah untuk penyu. Setidaknya terdapat empat jenis penyu, yakni seperti penyu sisik, penyu tempayan, penyu hijau, dan penyu lekang.